244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  100 
 
 		 363 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  43.31 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  44.7 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  38.65 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  40.24 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  38.5 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.17 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  34.92 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  37.6 
 
 		 472 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  35.38 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.64 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.97 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  31.58 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  36.54 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  41.94 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  31.03 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  31.07 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  36.75 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  36.16 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  46.35 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  36.92 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.57 
 
 		 360 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.57 
 
 		 360 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  36.18 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  35.53 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  29.68 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  31.05 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  36.75 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  30.29 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  30.29 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  30.29 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  30.29 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.29 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  33.44 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.3 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  27.94 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  35.38 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.99 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  34.11 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  35.5 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  35.84 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  33.24 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  28.98 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  28.52 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  31.91 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  34.96 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  34.01 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  34.28 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  35.57 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.48 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  30.12 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  33.59 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  29.26 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  35.22 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  35.22 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  33.81 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.78 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  31.9 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  33.81 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  29.02 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.29 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  33.81 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  33.81 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  34.3 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.4 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  32.14 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.08 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.52 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  34.67 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  39.02 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.19 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  34.1 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  25.71 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.19 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.19 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  33.24 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  30.19 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  31.75 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  30.3 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  29.71 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  28.07 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  25.91 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  35.62 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  29.69 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  28.21 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6041  hypothetical protein  41.28 
 
 		 288 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>