228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0054 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  722    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  42.55 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  40.52 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  33.43 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  33.79 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  33.93 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.82 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  31.56 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  32.55 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  31.69 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  25.99 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  35.44 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  26.74 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  27.06 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  26.53 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.47 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  26.74 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  26.79 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.05 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  25.99 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.26 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  28.23 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  28.23 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  25.07 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  29.5 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  28.22 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  29.76 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.64 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  29.41 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  27.45 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.38 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  22.47 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  36.86 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  27.11 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  28.25 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  28.25 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  25.67 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  33.96 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  28.18 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  26.84 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  29.17 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.64 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  29.17 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  29.17 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  29.17 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  27.5 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  29.17 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.7 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  26.88 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  28.29 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  29.92 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  25.6 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  27.85 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  29.26 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  35.6 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  28.79 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  28.29 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  27.03 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  26.9 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  22.83 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  28.34 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  30.79 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  28.57 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.22 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  21.83 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  22.54 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  27.73 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  28.29 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  27.79 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  27.64 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  28.8 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  29.28 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  27.88 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  27.49 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  26.84 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  28.84 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  25.61 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  25.61 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  27.82 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>