246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6041 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6041  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  50.4 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  41.08 
 
 		 411 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  41.98 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  48.28 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  38.91 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  38.91 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  41.82 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  36.92 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  40.81 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.64 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.25 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  48.53 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  34.06 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  35.91 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  35.14 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  35.14 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  35.52 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  35.14 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  35.14 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  34.75 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  34.75 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  41.12 
 
 		 441 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  38.61 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.59 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  33.59 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.89 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  35.44 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  37.2 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  34.65 
 
 		 336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  34.67 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  34.21 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  36.77 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  33.66 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  33.66 
 
 		 361 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  33.66 
 
 		 361 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  36.59 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  34.14 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  34.31 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  35.74 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  32.79 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  33 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  49.41 
 
 		 472 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.56 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  33.21 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  33.91 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  33.91 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  33.91 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  41.02 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  33.91 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  32.58 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  33.1 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  33.91 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  35.56 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  35.27 
 
 		 356 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  34.12 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  32.18 
 
 		 361 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  38.87 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.32 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.18 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.99 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  34.49 
 
 		 355 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  34.38 
 
 		 372 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  34.47 
 
 		 353 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  34.67 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  36.14 
 
 		 362 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.46 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  35.89 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  37.3 
 
 		 350 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  34.15 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  36.86 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  34.47 
 
 		 420 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  31.15 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  34.12 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  32.97 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  32.97 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  32.97 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  31.86 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  35.37 
 
 		 355 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  37.75 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  34.47 
 
 		 356 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  34.47 
 
 		 356 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  34.13 
 
 		 353 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  34.86 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  34.47 
 
 		 356 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  34.98 
 
 		 359 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  34.13 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  34.35 
 
 		 355 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  38.57 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>