255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  100 
 
 
441 aa  819    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  51.33 
 
 
361 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  41.22 
 
 
380 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  37.92 
 
 
360 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  37.92 
 
 
360 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  37.14 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  36.86 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  37.05 
 
 
354 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  39.93 
 
 
347 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  36.84 
 
 
352 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  39.6 
 
 
324 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  36.62 
 
 
355 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  38.02 
 
 
339 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  38.06 
 
 
411 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  36.94 
 
 
374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  39.19 
 
 
472 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  37.35 
 
 
343 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  35.91 
 
 
355 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  29.24 
 
 
331 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  31.07 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  31.07 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  31.32 
 
 
340 aa  140  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  33.11 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  45.22 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  34.93 
 
 
361 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  34.93 
 
 
361 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  34.45 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.42 
 
 
348 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  32.54 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  37.97 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.78 
 
 
346 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  35.96 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  30.64 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  37.63 
 
 
355 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  38.64 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  35.09 
 
 
353 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  36.64 
 
 
356 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  37.24 
 
 
356 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.15 
 
 
357 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  35.22 
 
 
348 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  36.94 
 
 
356 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  36.94 
 
 
356 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  38.65 
 
 
359 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  34.19 
 
 
349 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  34.19 
 
 
349 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  34.19 
 
 
349 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  34.19 
 
 
349 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  33.87 
 
 
349 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  36.8 
 
 
420 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  32.83 
 
 
361 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  36.26 
 
 
353 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.45 
 
 
338 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  34.32 
 
 
365 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  31.96 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  35.22 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  35.88 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  31.08 
 
 
363 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  32.11 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  33.55 
 
 
349 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.13 
 
 
352 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.13 
 
 
352 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.16 
 
 
340 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.51 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.16 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.8 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  32.49 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  34.83 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.51 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  35.91 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  33.1 
 
 
336 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  35.8 
 
 
355 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  30.35 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  34.74 
 
 
355 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  26.65 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  37.31 
 
 
360 aa  114  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  37.31 
 
 
360 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  31.8 
 
 
352 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.4 
 
 
340 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  42.86 
 
 
335 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  34.42 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  33.11 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  28.44 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  32.6 
 
 
339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  32.02 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  32.79 
 
 
331 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  31.33 
 
 
325 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.32 
 
 
337 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  31.19 
 
 
341 aa  110  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  25.9 
 
 
335 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.18 
 
 
335 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>