254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  100 
 
 
361 aa  661    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  51.57 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  45.26 
 
 
347 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  40.57 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  39.81 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  39.81 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  41.61 
 
 
355 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  39.63 
 
 
380 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  40.35 
 
 
374 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  38.92 
 
 
348 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  39.24 
 
 
339 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  36.36 
 
 
354 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  37.84 
 
 
472 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  36.87 
 
 
355 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  41.86 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  40.52 
 
 
340 aa  162  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  39.13 
 
 
352 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  40.24 
 
 
351 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  34.29 
 
 
348 aa  149  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  45.82 
 
 
335 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  32.7 
 
 
331 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  32.7 
 
 
331 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  33.8 
 
 
338 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  36.77 
 
 
340 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  35.4 
 
 
361 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  37.67 
 
 
304 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  36.28 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  38.12 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  29.78 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  35.44 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  34.68 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  38.64 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  40.42 
 
 
359 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  37.93 
 
 
343 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  37.5 
 
 
361 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  37.5 
 
 
361 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  35.29 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.98 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  38.05 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  36.17 
 
 
352 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  36.52 
 
 
340 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  35.82 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  35.76 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  32.81 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  35.46 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  35.82 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  37.68 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  37.98 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  34.92 
 
 
329 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  35.46 
 
 
352 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  35.64 
 
 
343 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  37.35 
 
 
348 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  35.46 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  34.8 
 
 
343 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  41.03 
 
 
355 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  36.63 
 
 
349 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  41.46 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  35.85 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  36.68 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  36.68 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  36.68 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  34.02 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  36.68 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  36.68 
 
 
349 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  32.18 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  38.83 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  34.55 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  38.62 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  29.97 
 
 
331 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  40 
 
 
365 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  38.28 
 
 
343 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  38.83 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  38.62 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  38.83 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  36.52 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  38.81 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  35.12 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.32 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  38.83 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  41.05 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  34.27 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  38.31 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  34.93 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  35.24 
 
 
356 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  33 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  33.54 
 
 
340 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  35.25 
 
 
361 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  34.1 
 
 
368 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  38.81 
 
 
353 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  38.19 
 
 
420 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  34.82 
 
 
345 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>