14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1601 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 939 aa  1890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  27.41 
 
 		 957 aa  300  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 952 aa  286  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  28.42 
 
 		 1090 aa  280  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1108 aa  267  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  28.9 
 
 		 941 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  28.39 
 
 		 922 aa  225  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1016 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  24.08 
 
 		 952 aa  200  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 1058 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.09 
 
 		 1000 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  33.94 
 
 		 278 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 275 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1024 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>