67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0364 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 938 aa  1839    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 		 890 aa  178  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.44 
 
 		 1000 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1771  Tetratricopeptide TPR_4  25.89 
 
 		 339 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 1024 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 418 aa  56.2  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 433 aa  55.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 886 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.45 
 
 		 729 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.74 
 
 		 1001 aa  53.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 934 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 639 aa  52  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 804 aa  51.6  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1023 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.64 
 
 		 632 aa  51.2  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  29.27 
 
 		 420 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 420 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  29.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 		 420 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 		 420 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 420 aa  48.9  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 574 aa  48.9  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 230 aa  48.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  28.74 
 
 		 420 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  22.43 
 
 		 575 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  28.74 
 
 		 420 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  22.44 
 
 		 709 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 313 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  22.73 
 
 		 425 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 		 638 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 645 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  23.58 
 
 		 1006 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.41 
 
 		 882 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 		 1019 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  22.08 
 
 		 424 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  28.66 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  23.36 
 
 		 590 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  21.6 
 
 		 389 aa  46.2  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 557 aa  46.2  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  23.62 
 
 		 384 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  26.77 
 
 		 268 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  23.62 
 
 		 385 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  29.41 
 
 		 301 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 522 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  25.98 
 
 		 272 aa  45.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 436 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 626 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 413 aa  45.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  29.75 
 
 		 389 aa  45.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 274 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  22.08 
 
 		 424 aa  45.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 421 aa  45.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 357 aa  44.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 248 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  27.91 
 
 		 268 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  25.98 
 
 		 271 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  25.2 
 
 		 274 aa  44.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  44.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 357 aa  44.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  25.98 
 
 		 268 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 758 aa  44.3  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>