160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0853 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  92.24 
 
 		 425 aa  798    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 424 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  98.35 
 
 		 424 aa  851    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  68.42 
 
 		 409 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  67.15 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  54.59 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  54.52 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  54.83 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  54.83 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  55 
 
 		 391 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  53.57 
 
 		 391 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  55.07 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  53.62 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  55.31 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  53.38 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  48.09 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  48.2 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  47.61 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  48.07 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  41.45 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  41.45 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  42.38 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2472  tetratricopeptide repeat protein  40.62 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.3368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1388  tetratricopeptide repeat protein  40.86 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0712872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1563  tetratricopeptide repeat protein  39.19 
 
 		 385 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  37.5 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  39.29 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  38.89 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3288  tetratricopeptide repeat protein  37.1 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  35.32 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  38 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  36.75 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2799  tetratricopeptide repeat protein  37.41 
 
 		 381 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000578522 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  35.38 
 
 		 388 aa  236  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3911  tetratricopeptide repeat protein  39 
 
 		 385 aa  236  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0297232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1611  tetratricopeptide repeat protein  37.41 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  35.38 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  35.41 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  34.55 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  34.55 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  31.22 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  31.22 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  35.7 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  29.24 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  31.94 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  31.54 
 
 		 390 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  31.2 
 
 		 390 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  31.2 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  31.95 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  35.65 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  32.83 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  32.19 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  32.19 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  32.19 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  32.19 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  32.19 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  30.52 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  31.86 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  31.14 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  30.27 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  31.55 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  33.51 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  31.37 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  29.78 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  30.02 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  30.02 
 
 		 386 aa  196  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  30.02 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  30.43 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  30.31 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  32.13 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  31.19 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  31.19 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  31.19 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  28.85 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  29.24 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  28.78 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  29.98 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  30.94 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  29.51 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  29.51 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  29.51 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  29.61 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>