43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0967 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 890 aa  1800    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 		 938 aa  178  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.35 
 
 		 1000 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 357 aa  56.2  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.38 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 1001 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 357 aa  54.7  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.38 
 
 		 561 aa  54.7  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 313 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.71 
 
 		 344 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 344 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1023 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 883 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 565 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  41.25 
 
 		 322 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  41.25 
 
 		 322 aa  48.5  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.06 
 
 		 1979 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 264 aa  48.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1180 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.32 
 
 		 810 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.89 
 
 		 729 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1012 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  34.67 
 
 		 283 aa  47.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 245 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 275 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 359 aa  46.6  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.83 
 
 		 746 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2735  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00105552  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 4079 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  34.67 
 
 		 283 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0547  tetratricopeptide repeat domain protein  26.32 
 
 		 214 aa  45.4  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0590314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 934 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1004 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  22.8 
 
 		 1006 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 278 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 586 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 250 aa  45.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6494  hypothetical protein  25.37 
 
 		 823 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 226 aa  44.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3842  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 702 aa  44.3  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  38.89 
 
 		 263 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>