247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0755 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
421 aa  849    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  44.88 
 
 
421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
433 aa  224  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  30.27 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
414 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
414 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
420 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
418 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
420 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  30.27 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
420 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  30.27 
 
 
420 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
420 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
420 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
420 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  30.02 
 
 
420 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  30.02 
 
 
420 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  30.02 
 
 
420 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
413 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
409 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.26 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.26 
 
 
577 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 
222 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.93 
 
 
935 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.33 
 
 
810 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
878 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.36 
 
 
2240 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.08 
 
 
586 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.36 
 
 
1676 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
3145 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 
1486 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1056 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
265 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.2 
 
 
758 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.34 
 
 
725 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
222 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
222 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  27.59 
 
 
1826 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
979 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 
632 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.94 
 
 
1737 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.55 
 
 
1154 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.29 
 
 
681 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.06 
 
 
1101 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.96 
 
 
1056 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
827 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 
1022 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
301 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
750 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.3 
 
 
1979 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
359 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
562 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.14 
 
 
988 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
4079 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  21.3 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.4 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1112 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.47 
 
 
809 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.2 
 
 
676 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 
968 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
673 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
1252 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 
924 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.59 
 
 
632 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 
818 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.78 
 
 
832 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  19.88 
 
 
448 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
404 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
219 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  22.48 
 
 
1077 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
643 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
596 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 
638 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 
725 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.78 
 
 
261 aa  51.2  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
227 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
573 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  24.21 
 
 
219 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
617 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0488  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 
556 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1834  hypothetical protein  26.56 
 
 
339 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.434531  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  24.21 
 
 
219 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.68 
 
 
887 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.78 
 
 
738 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.78 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.78 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
1161 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>