22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4088 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4088  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1057 aa  2137    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.475202  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  30.69 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  34.34 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  32.04 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 267 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 262 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.1 
 
 		 232 aa  53.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  30.39 
 
 		 275 aa  51.6  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  30.3 
 
 		 267 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 283 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 3035 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 505 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.55 
 
 		 283 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 		 269 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 		 269 aa  46.2  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  28 
 
 		 301 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 		 269 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 		 272 aa  45.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 1058 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>