214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2382 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  92.49 
 
 		 187 aa  333  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  78.03 
 
 		 173 aa  287  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  72.83 
 
 		 173 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  73.41 
 
 		 173 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  72.83 
 
 		 173 aa  271  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  69.36 
 
 		 173 aa  257  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  68.79 
 
 		 173 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  68.79 
 
 		 173 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  68.21 
 
 		 173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  59.54 
 
 		 173 aa  227  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  58.38 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  55.49 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  56.07 
 
 		 173 aa  214  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  57.8 
 
 		 182 aa  214  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  56.65 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  57.23 
 
 		 173 aa  204  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  56.65 
 
 		 173 aa  203  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  33.08 
 
 		 828 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.64 
 
 		 1022 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3145 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 988 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 465 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 		 616 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 		 818 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1238 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1285 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 		 1056 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 430 aa  51.2  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 		 784 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.46 
 
 		 820 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 1060 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 615 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 750 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 632 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 1186 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1276 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 1252 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 1252 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.33 
 
 		 1000 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 878 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 586 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.6 
 
 		 1077 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1138 aa  47.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.77 
 
 		 340 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 935 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.45 
 
 		 732 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.13 
 
 		 875 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1091 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1121 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 605 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 543 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 649 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 843 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.21 
 
 		 887 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1092 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.84 
 
 		 725 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 409 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 836 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 349 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 		 461 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1421 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 481 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 288 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 		 404 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 289 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.15 
 
 		 2145 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 402 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.53 
 
 		 850 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.34 
 
 		 587 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  34.65 
 
 		 733 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  30.93 
 
 		 395 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 784 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  29.41 
 
 		 952 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 593 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.25 
 
 		 837 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  39.34 
 
 		 936 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.12 
 
 		 708 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 761 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1406 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  36.59 
 
 		 548 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 		 782 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  35.62 
 
 		 809 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 395 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 453 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 670 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 226 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 200 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.93 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1827 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>