More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2001 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0672  TPR repeat-containing protein  49.48 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1897  TPR repeat-containing protein  49.23 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 1022 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.61 
 
 		 818 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 543 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 		 1056 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 		 784 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 836 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  37.21 
 
 		 750 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 1094 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 		 988 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 927 aa  61.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1406 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 3035 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.33 
 
 		 629 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1276 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 3560 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 3172 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  37.35 
 
 		 1007 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.44 
 
 		 820 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 376 aa  58.2  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.05 
 
 		 745 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  33.66 
 
 		 1056 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1049 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.07 
 
 		 560 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 592 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.83 
 
 		 875 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  33.05 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 4079 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.41 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.69 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.91 
 
 		 715 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 1694 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 4489 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 515 aa  54.7  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 713 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 632 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 366 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1138 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  35.71 
 
 		 417 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 1979 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 732 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 361 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 935 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  34.44 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.83 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 270 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.53 
 
 		 706 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43199  predicted protein  31.48 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.847527  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 711 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 523 aa  52.4  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.86 
 
 		 314 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 1069 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1827 aa  52  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0002  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 		 128 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00992655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 635 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 245 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 621 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 250 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 605 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 520 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 662 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25 
 
 		 573 aa  52  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 306 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.46 
 
 		 462 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 		 707 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  48 
 
 		 266 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 1121 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>