80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0134 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  97.69 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  95.95 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  93.06 
 
 		 173 aa  333  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  78.03 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  73.99 
 
 		 173 aa  279  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  73.41 
 
 		 173 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  68.79 
 
 		 173 aa  258  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  68.21 
 
 		 173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  67.05 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  47.4 
 
 		 196 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  45.09 
 
 		 173 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  45.09 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  44.51 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  45.66 
 
 		 173 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  45.66 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1285 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 818 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 		 828 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 		 988 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 616 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.32 
 
 		 784 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 3145 aa  47.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 		 1022 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.18 
 
 		 1056 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 503 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.32 
 
 		 875 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 615 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  31.33 
 
 		 957 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.83 
 
 		 733 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 465 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 750 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 649 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 		 1056 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 		 782 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.43 
 
 		 1764 aa  44.3  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1063 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 670 aa  44.3  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1276 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1101 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 481 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.71 
 
 		 741 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 		 358 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 847 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1550 aa  42.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.96 
 
 		 878 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  35.09 
 
 		 1083 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2145 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 382 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1313 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.64 
 
 		 820 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 935 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1105 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  28.35 
 
 		 538 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.22 
 
 		 587 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 718 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 409 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.31 
 
 		 725 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 866 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 249 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 467 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1261 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 249 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.56 
 
 		 810 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 295 aa  41.2  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 762 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  33 
 
 		 672 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1404 aa  41.2  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 402 aa  40.8  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.61 
 
 		 740 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  33.71 
 
 		 1507 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 550 aa  41.2  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1371 aa  40.8  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1424 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 711 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>