153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0552 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  77.46 
 
 		 196 aa  284  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  80.92 
 
 		 173 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  80.35 
 
 		 173 aa  280  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  75.14 
 
 		 173 aa  279  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  75.72 
 
 		 173 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  72.83 
 
 		 173 aa  273  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  74.57 
 
 		 182 aa  273  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  57.23 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  56.07 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  56.65 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  47.98 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  46.24 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  45.66 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  46.24 
 
 		 173 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  46.24 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  45.66 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  44.51 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.81 
 
 		 1056 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 		 988 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1238 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 1060 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 718 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 828 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.39 
 
 		 708 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.62 
 
 		 1022 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.31 
 
 		 733 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 349 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 343 aa  51.2  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.78 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1421 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 543 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 1056 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.33 
 
 		 818 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1550 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 		 784 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 295 aa  48.9  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1450 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 339 aa  48.9  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 628 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 3145 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 782 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 280 aa  47.8  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.67 
 
 		 809 aa  47.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.77 
 
 		 750 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 750 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 843 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 605 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  34.07 
 
 		 740 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1526 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2145 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 357 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  32.11 
 
 		 957 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 758 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 295 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 295 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1121 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 1486 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 		 1424 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 927 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 617 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2538  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 447 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 466 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.8 
 
 		 820 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 288 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 547 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 277 aa  44.3  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 291 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 391 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 1186 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.9 
 
 		 439 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 425 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.46 
 
 		 936 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 586 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 827 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  32.77 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 412 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  29.17 
 
 		 757 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.36 
 
 		 810 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 1266 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 366 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.9 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1091 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 356 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 607 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1274 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 870 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  33.02 
 
 		 635 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>