124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0310 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 187 aa  386  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  92.49 
 
 		 173 aa  333  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  76.3 
 
 		 173 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  72.25 
 
 		 173 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  72.25 
 
 		 173 aa  270  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  71.68 
 
 		 173 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  67.63 
 
 		 173 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  68.21 
 
 		 173 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  67.63 
 
 		 173 aa  250  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  67.05 
 
 		 173 aa  249  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  60.12 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  58.38 
 
 		 182 aa  220  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  56.07 
 
 		 173 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  56.07 
 
 		 173 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  51.63 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  56.65 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  53.18 
 
 		 173 aa  205  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  56.07 
 
 		 173 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 828 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35 
 
 		 1056 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 818 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 988 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 		 1056 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 465 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.64 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 784 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 		 809 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3145 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.32 
 
 		 957 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.46 
 
 		 820 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 1121 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1161 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 1252 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 1252 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 		 550 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 366 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 649 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.13 
 
 		 875 aa  47.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  27.19 
 
 		 461 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 406 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 		 632 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1138 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1238 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.77 
 
 		 850 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.07 
 
 		 810 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1285 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 605 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 836 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 782 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 750 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 762 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 543 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 935 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1276 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 1154 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.6 
 
 		 1077 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.34 
 
 		 587 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 878 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.46 
 
 		 1186 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  40.35 
 
 		 1083 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30 
 
 		 340 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 404 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 363 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1049 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1091 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 453 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.6 
 
 		 725 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1092 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.38 
 
 		 2145 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  31.63 
 
 		 2327 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1486 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 409 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28 
 
 		 1764 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 955 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.16 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  30.85 
 
 		 825 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.79 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.84 
 
 		 887 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 1261 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 4079 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 602 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 547 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 349 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 670 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.29 
 
 		 581 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 		 2240 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 843 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 392 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.97 
 
 		 732 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  34.15 
 
 		 548 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.91 
 
 		 733 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.45 
 
 		 545 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>