120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2321 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 173 aa  361  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  75.72 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  72.83 
 
 		 173 aa  273  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  71.1 
 
 		 173 aa  273  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  71.68 
 
 		 173 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  71.1 
 
 		 196 aa  271  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  73.99 
 
 		 173 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  73.99 
 
 		 173 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  60.12 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  59.54 
 
 		 173 aa  227  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  58.38 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  49.71 
 
 		 173 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  50.87 
 
 		 173 aa  197  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  50.29 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  183  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  46.82 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1238 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1550 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1526 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.62 
 
 		 988 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 		 1022 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.59 
 
 		 1056 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1421 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.89 
 
 		 1056 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.96 
 
 		 2145 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 		 809 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.46 
 
 		 733 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 		 957 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.8 
 
 		 820 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 1486 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 750 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.52 
 
 		 708 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 543 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.9 
 
 		 626 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 782 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.97 
 
 		 1764 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1404 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 843 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 391 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0979  GGDEF family protein  31.78 
 
 		 667 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 		 538 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 361 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1285 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 250 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 548 aa  44.3  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 688 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 527 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1060 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 207 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 750 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 412 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 		 626 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 614 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 614 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 811 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1450 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 356 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 595 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1121 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 635 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 992 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 3145 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 343 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31 
 
 		 560 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 1186 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2538  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 447 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 818 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 784 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04215  TPR domain protein  28.24 
 
 		 458 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.387163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 1279 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.02 
 
 		 561 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31 
 
 		 1228 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 293 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1054 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 		 875 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 622 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1049 aa  41.6  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1503  tetratricopeptide TPR_2  44.68 
 
 		 751 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.388134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  24.82 
 
 		 451 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.38 
 
 		 706 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 339 aa  41.6  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1092 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 628 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 955 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 295 aa  42  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 878 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 626 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 453 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 725 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 810 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1211  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 237 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0177658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 349 aa  41.2  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>