164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1667 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  63.9 
 
 		 254 aa  335  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  36.36 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  34.91 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  38.5 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  28.4 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 454 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  32.14 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.99 
 
 		 725 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 762 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.47 
 
 		 810 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 573 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 466 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 984 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 718 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.47 
 
 		 676 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 740 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 466 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  31.76 
 
 		 451 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  25.32 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 643 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 608 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 878 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.93 
 
 		 733 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 565 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 636 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 453 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 750 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 635 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 635 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.61 
 
 		 875 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 611 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 612 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 637 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 1737 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 639 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 457 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 2262 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 685 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 792 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  21.74 
 
 		 1930 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 626 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 637 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 909 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 626 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1827 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 465 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 1694 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 465 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 601 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.55 
 
 		 884 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.9 
 
 		 816 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 566 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 602 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.9 
 
 		 681 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.53 
 
 		 1764 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 4489 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 543 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 596 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 605 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.44 
 
 		 632 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 420 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 602 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1371 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>