143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1503 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1503  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 751 aa  1552    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.388134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.45 
 
 		 810 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 3145 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 878 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 632 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  26.95 
 
 		 1098 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.13 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.13 
 
 		 708 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.34 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.29 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.76 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.13 
 
 		 1056 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.56 
 
 		 706 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.58 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 601 aa  55.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 585 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 1034 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 754 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 543 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  30.4 
 
 		 825 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 409 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 949 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1005 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 750 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 732 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 718 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 792 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 991 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 244 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 361 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 1406 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 566 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 927 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 311 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.24 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.22 
 
 		 706 aa  51.6  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.63 
 
 		 865 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  26.27 
 
 		 703 aa  50.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.57 
 
 		 561 aa  51.2  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1138 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 706 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 3301 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 3172 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1060 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.08 
 
 		 2145 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 293 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 384 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.57 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 827 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 955 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.26 
 
 		 1421 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.86 
 
 		 582 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 589 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 		 828 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.05 
 
 		 503 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 375 aa  48.5  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  24.64 
 
 		 897 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 265 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 178 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 391 aa  48.5  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.89 
 
 		 1666 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 		 818 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 550 aa  48.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 1049 aa  47.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 357 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.93 
 
 		 1009 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 595 aa  47.8  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.12 
 
 		 266 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 725 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.38 
 
 		 732 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 		 576 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.78 
 
 		 620 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  29.7 
 
 		 1588 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.52 
 
 		 747 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 189 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 265 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 708 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.95 
 
 		 935 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  26.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.53 
 
 		 878 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 957 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 843 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  27.87 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  22 
 
 		 632 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 		 1056 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>