More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1376 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1261 aa  2528    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 
985 aa  251  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 
782 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.93 
 
 
1914 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.36 
 
 
2145 aa  231  8e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
1313 aa  196  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
1060 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
1714 aa  191  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.08 
 
 
1266 aa  188  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  28.76 
 
 
1238 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 
991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
1450 aa  173  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.44 
 
 
1328 aa  164  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.11 
 
 
725 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.22 
 
 
1507 aa  158  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
1596 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1526 aa  153  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 
957 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 
771 aa  146  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.82 
 
 
1676 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 
1040 aa  144  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.44 
 
 
1180 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1215 aa  137  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  23.39 
 
 
941 aa  136  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
454 aa  135  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
1186 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
1101 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
1288 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.93 
 
 
1550 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
878 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.08 
 
 
810 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.67 
 
 
493 aa  128  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.49 
 
 
799 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1063 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.45 
 
 
740 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.88 
 
 
732 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.52 
 
 
828 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 
1424 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 
636 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.45 
 
 
1044 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.88 
 
 
1009 aa  116  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.2 
 
 
609 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
412 aa  115  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
408 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.29 
 
 
836 aa  115  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.15 
 
 
694 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.87 
 
 
825 aa  112  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
924 aa  112  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
1279 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
949 aa  111  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
760 aa  110  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
343 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.23 
 
 
755 aa  109  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.17 
 
 
1022 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.76 
 
 
1404 aa  107  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.66 
 
 
340 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
714 aa  105  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 
885 aa  104  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
436 aa  103  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 
809 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.02 
 
 
1737 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
438 aa  98.6  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
843 aa  98.2  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 
1162 aa  98.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
568 aa  98.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
568 aa  98.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.95 
 
 
1056 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
1285 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  19.92 
 
 
1911 aa  97.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.35 
 
 
2327 aa  97.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.11 
 
 
787 aa  97.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.55 
 
 
708 aa  96.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.7 
 
 
887 aa  95.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.9 
 
 
1162 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 
872 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1054 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
1486 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
448 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 
852 aa  92.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.84 
 
 
1147 aa  91.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.63 
 
 
490 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.57 
 
 
1039 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
850 aa  89.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 
945 aa  89.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 
833 aa  89  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
907 aa  88.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 
767 aa  88.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.14 
 
 
1131 aa  88.2  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.12 
 
 
1291 aa  88.2  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.29 
 
 
725 aa  88.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  22.16 
 
 
671 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
923 aa  87  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
909 aa  86.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
1290 aa  86.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.77 
 
 
822 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.95 
 
 
1295 aa  85.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 
927 aa  85.1  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.09 
 
 
1056 aa  85.1  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
1429 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>