More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3729 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  100 
 
 		 340 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  60.64 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 1060 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 991 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.63 
 
 		 782 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  37.81 
 
 		 828 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1313 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  31.73 
 
 		 985 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 412 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.1 
 
 		 1266 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1101 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.75 
 
 		 1009 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.06 
 
 		 725 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.43 
 
 		 957 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.33 
 
 		 2145 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 1063 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 1914 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1550 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  39.91 
 
 		 1212 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1238 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1714 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 949 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 438 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 923 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1404 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.72 
 
 		 809 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 454 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 		 1186 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1261 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 760 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1450 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.7 
 
 		 825 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.67 
 
 		 689 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  29.66 
 
 		 755 aa  99.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.18 
 
 		 941 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.61 
 
 		 609 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.87 
 
 		 493 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 1048 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  24.71 
 
 		 941 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 		 742 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 1288 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 425 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 659 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 568 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31.2 
 
 		 1228 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 568 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  26.12 
 
 		 1020 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 636 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.76 
 
 		 740 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 1162 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  27.72 
 
 		 928 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  25.77 
 
 		 1021 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1596 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 850 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 		 1279 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1162 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  24.89 
 
 		 965 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.08 
 
 		 732 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.66 
 
 		 1328 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  23.83 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3789  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  23.77 
 
 		 788 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1025 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  27.68 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.07 
 
 		 999 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 		 1295 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1360 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.54 
 
 		 560 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  25.69 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  23.13 
 
 		 790 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1526 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 843 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.37 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 907 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  29.83 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.19 
 
 		 1291 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 767 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.73 
 
 		 946 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.02 
 
 		 919 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.61 
 
 		 981 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 		 885 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.29 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 872 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  23.83 
 
 		 1106 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  23.47 
 
 		 992 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1105 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 771 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1215 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.51 
 
 		 1507 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 		 775 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.74 
 
 		 2413 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26 
 
 		 2327 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.95 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  22.06 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>