176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2835 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 868 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 782 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1060 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1313 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.74 
 
 		 991 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1101 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  30.91 
 
 		 985 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 		 1266 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 828 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1063 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  29.47 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  27.23 
 
 		 689 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 957 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 760 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.65 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.12 
 
 		 1009 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 923 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 1145 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.6 
 
 		 2145 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.05 
 
 		 609 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 1162 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 949 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1916  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1172 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.506674  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1162 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1212 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1298 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  26.55 
 
 		 1020 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.64 
 
 		 1226 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1550 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 852 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  25 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1025 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 1025 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1261 aa  58.9  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.51 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  30.88 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.73 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2413 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 1088 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1238 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  26.79 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.35 
 
 		 1147 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  26.78 
 
 		 928 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 613 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.29 
 
 		 945 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1404 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 941 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 742 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1081  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 540 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000375934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1039 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 1186 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1054 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.91 
 
 		 755 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 613 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 1429 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.17 
 
 		 941 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 1048 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 		 1013 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 714 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  33.61 
 
 		 1083 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.07 
 
 		 1279 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  27.56 
 
 		 490 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 		 659 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 854 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 915 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 1054 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.84 
 
 		 825 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.11 
 
 		 919 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 856 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  27.65 
 
 		 603 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.65 
 
 		 1271 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 		 1153 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.36 
 
 		 732 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  30.08 
 
 		 1826 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 436 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 993 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 964 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2412  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  27.59 
 
 		 965 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 896 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  20.1 
 
 		 809 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  30.07 
 
 		 992 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  25.37 
 
 		 816 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  27.65 
 
 		 603 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 438 aa  49.7  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0287  hypothetical protein  29.81 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>