More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2207 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 760 aa  1547    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  38.27 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  37.79 
 
 		 485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.11 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  38.16 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  38.16 
 
 		 433 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  37.17 
 
 		 433 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 469 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  37.17 
 
 		 433 aa  151  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 563 aa  150  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  38.16 
 
 		 433 aa  150  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  37.66 
 
 		 433 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  37.13 
 
 		 433 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  36.24 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 535 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  36.71 
 
 		 433 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  36.05 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  34.23 
 
 		 347 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 430 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  37.87 
 
 		 433 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  36.28 
 
 		 433 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  36.28 
 
 		 433 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  36.28 
 
 		 433 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  35.37 
 
 		 452 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  36.28 
 
 		 433 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  32.77 
 
 		 376 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  35.68 
 
 		 437 aa  147  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 458 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 376 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 478 aa  147  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  36.29 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  38.84 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 376 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 417 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 376 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 376 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  34.96 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 535 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  35.24 
 
 		 437 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  37.93 
 
 		 561 aa  145  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 376 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 536 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 371 aa  144  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 456 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 442 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 442 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 442 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  33.06 
 
 		 442 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 401 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.48 
 
 		 433 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 428 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  31.95 
 
 		 451 aa  141  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 433 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 535 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 450 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 442 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 472 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.31 
 
 		 536 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 550 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  32.6 
 
 		 428 aa  139  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  33.64 
 
 		 428 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.33 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  33.04 
 
 		 434 aa  134  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  33.63 
 
 		 432 aa  134  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  33.04 
 
 		 434 aa  134  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  31.53 
 
 		 429 aa  134  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  34.19 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 480 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  33.48 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1060 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 446 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3281  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 483 aa  127  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00282133  hitchhiker  0.000112665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  31.19 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  23.9 
 
 		 982 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  33.49 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 		 782 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>