More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3130 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 408 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  40.72 
 
 		 782 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  44.26 
 
 		 985 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 1060 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  34.09 
 
 		 1266 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1313 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 991 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  35.06 
 
 		 725 aa  163  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1101 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.53 
 
 		 828 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1238 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  35.54 
 
 		 689 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1063 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  29.92 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 957 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 1186 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 923 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  30 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1550 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  31.43 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.53 
 
 		 2145 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 1020 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.06 
 
 		 1914 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1714 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.09 
 
 		 809 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 438 aa  99.8  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 		 1162 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.15 
 
 		 609 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1162 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.97 
 
 		 941 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  23.86 
 
 		 1180 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 850 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  31.6 
 
 		 991 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 760 aa  90.1  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.64 
 
 		 1009 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.3 
 
 		 636 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1596 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1025 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1298 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 852 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1450 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.72 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1526 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.88 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  28.17 
 
 		 1025 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.88 
 
 		 1147 aa  84  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 1021 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.41 
 
 		 825 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.97 
 
 		 1054 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.67 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 971 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.18 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1215 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 		 767 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 1013 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  26.16 
 
 		 965 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 1279 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 659 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.27 
 
 		 1106 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 		 1295 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1404 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 1048 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.27 
 
 		 1328 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  26.15 
 
 		 643 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 965 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2275  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.33 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 928 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1212 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.1 
 
 		 981 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 949 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  31.19 
 
 		 827 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.52 
 
 		 1040 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  31.32 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  27.31 
 
 		 992 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  24.7 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.62 
 
 		 1017 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.91 
 
 		 945 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.63 
 
 		 1228 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 1071 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  31.32 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0772  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 636 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  31.39 
 
 		 834 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 878 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1039 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 843 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>