36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0702 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  46.21 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  44.6 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  42.95 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  40.29 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  41.13 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  43.51 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.29 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  31.51 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  32.87 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  29.32 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 566 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.8 
 
 		 725 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.53 
 
 		 545 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.53 
 
 		 587 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  26.14 
 
 		 338 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.97 
 
 		 733 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.36 
 
 		 992 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  29.25 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.77 
 
 		 967 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 420 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 492 aa  41.6  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 399 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 906 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.03 
 
 		 924 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  27.1 
 
 		 594 aa  40.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>