28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1767 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  94.67 
 
 		 150 aa  285  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.29 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  37.31 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  35.66 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  34.97 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  31.43 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1676 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 		 271 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  34.52 
 
 		 594 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.08 
 
 		 725 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.91 
 
 		 545 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.17 
 
 		 587 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  25.25 
 
 		 631 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 562 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  34.85 
 
 		 837 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>