34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1057 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  61.94 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  52.24 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  49.59 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  49.17 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.81 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  40.65 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  37.31 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.59 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  31.67 
 
 		 306 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  31.67 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 259 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 278 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 271 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.06 
 
 		 764 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.06 
 
 		 622 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 468 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 689 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 808 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 559 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 617 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  36.23 
 
 		 647 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  40.58 
 
 		 626 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 776 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 619 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 1252 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 468 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 		 572 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>