More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4101 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 572 aa  1165    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  32.95 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  35.86 
 
 		 403 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  33.75 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  29.45 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 546 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  29.05 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  29.22 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 535 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 535 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  27.44 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  29.64 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  28.48 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 547 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 416 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  28.8 
 
 		 555 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  30.57 
 
 		 540 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.83 
 
 		 546 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  31.39 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  26.6 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  26.28 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 513 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  25 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  23.2 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.62 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 130 aa  66.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 		 129 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 129 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  31.16 
 
 		 134 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  21.37 
 
 		 576 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.01 
 
 		 695 aa  62  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2914  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.94 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.56 
 
 		 131 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  30.53 
 
 		 188 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 139 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  32 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  29.6 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  26.06 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  26.06 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  26.76 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>