More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2318 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  100 
 
 
403 aa  828    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  33.17 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 
551 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  31.74 
 
 
416 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  35.76 
 
 
546 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  35.86 
 
 
572 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 
560 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  31.51 
 
 
549 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  30.73 
 
 
535 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  30.73 
 
 
535 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  30.73 
 
 
535 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  32.59 
 
 
537 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  30.24 
 
 
535 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  32.08 
 
 
533 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  31.5 
 
 
533 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  30.48 
 
 
534 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  30.39 
 
 
540 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  27.27 
 
 
546 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  32.2 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  25.19 
 
 
535 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  27.99 
 
 
561 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  28.83 
 
 
547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  26.8 
 
 
538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  30.38 
 
 
587 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  28.96 
 
 
540 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  26.88 
 
 
577 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  27.43 
 
 
553 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  26.55 
 
 
513 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  26.39 
 
 
555 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  27.15 
 
 
561 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  27.78 
 
 
533 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  24.6 
 
 
539 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
129 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 
139 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
127 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.83 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
127 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.09 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
129 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
131 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  33.88 
 
 
124 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 
131 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
188 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  33.88 
 
 
128 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 
128 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
132 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  32.23 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
131 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.84 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 
127 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32 
 
 
131 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
130 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.45 
 
 
129 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
126 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  33.06 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  32.77 
 
 
129 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>