63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0728 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  61.94 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  43.54 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  47.33 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  38.78 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.29 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  32.19 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  30.82 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  27.66 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29 
 
 		 725 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  36.21 
 
 		 545 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  36.21 
 
 		 587 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 265 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 789 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 700 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 589 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 927 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 804 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  29.81 
 
 		 779 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 280 aa  42  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 425 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.97 
 
 		 810 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1096 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  31.88 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  34.18 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  29.27 
 
 		 566 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.39 
 
 		 1022 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 652 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 245 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 878 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 576 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  26.26 
 
 		 407 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 871 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 544 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 		 699 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 1252 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.18 
 
 		 415 aa  40  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 1252 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  24.42 
 
 		 1004 aa  40  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  32.05 
 
 		 737 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>