21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0607 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  89.63 
 
 		 164 aa  304  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  41.48 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  39.83 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  33.09 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.09 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  31.39 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  28.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  28.37 
 
 		 278 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  27.41 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 359 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 632 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>