20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1585 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 150 aa  299  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.03 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  54.29 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  37.68 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  38.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  31.93 
 
 		 306 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  28.79 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  31.09 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  33.96 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 271 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3473  TPR repeat-containing protein  42.22 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0242658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>