114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3473 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3473  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0242658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3461  TPR repeat-containing protein  59.74 
 
 		 154 aa  186  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  31.36 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 363 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.01 
 
 		 725 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.07 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.1 
 
 		 587 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 486 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 358 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.3 
 
 		 340 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 750 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.55 
 
 		 764 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 344 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 344 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  33.67 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.55 
 
 		 622 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 423 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 329 aa  48.9  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  25.77 
 
 		 545 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 448 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1450 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.78 
 
 		 545 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  34.88 
 
 		 729 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 700 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 760 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32.38 
 
 		 780 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 505 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  26.26 
 
 		 336 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 878 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 810 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 405 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 510 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.73 
 
 		 266 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 632 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 		 448 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1021  phosphotransferase domain-containing protein  30.59 
 
 		 334 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.44555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 714 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.53 
 
 		 661 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 689 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 612 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 565 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 1737 aa  43.9  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 714 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.77 
 
 		 541 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 955 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.48 
 
 		 887 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  19.35 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 804 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 399 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 364 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.44 
 
 		 865 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 638 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4301  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406426  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 927 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.65 
 
 		 267 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2868  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 		 3301 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  30.23 
 
 		 569 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 385 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 		 494 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  30.38 
 
 		 464 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.93 
 
 		 762 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.93 
 
 		 762 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 875 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 634 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 307 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0031  Tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 3172 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1104 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 313 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  26.13 
 
 		 499 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 722 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 968 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 827 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 267 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 311 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  30.19 
 
 		 1267 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  29.49 
 
 		 872 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  25.83 
 
 		 651 aa  41.2  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 965 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 883 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 969 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.81 
 
 		 745 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.22 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 653 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>