More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2413 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 739 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  26.32 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.93 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 714 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.97 
 
 		 816 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.84 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.82 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.01 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.29 
 
 		 780 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  37.17 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.89 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 502 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 583 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 808 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.59 
 
 		 545 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  26.56 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 637 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 618 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.99 
 
 		 865 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 792 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.89 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 574 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.15 
 
 		 2401 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.98 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.58 
 
 		 473 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 550 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 		 1979 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 599 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 543 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 878 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 632 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  29.49 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 762 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.9 
 
 		 882 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.9 
 
 		 882 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 578 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.1 
 
 		 560 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.4 
 
 		 739 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.9 
 
 		 566 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 574 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 620 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  28.9 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1276 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  30.77 
 
 		 529 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 974 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 562 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 968 aa  53.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 3172 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 553 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 472 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 3301 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1297 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  33.73 
 
 		 603 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 3035 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 557 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 822 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.71 
 
 		 620 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  30.4 
 
 		 544 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  27.13 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 653 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 626 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 761 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  33.96 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.08 
 
 		 623 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 614 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 637 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 614 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 614 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 643 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  31.46 
 
 		 653 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  24.8 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  24.75 
 
 		 937 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 614 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>