24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0701 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  306  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  49.62 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  41.43 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  39.72 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  34.01 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  31.21 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  31.11 
 
 		 306 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.11 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 634 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  28.28 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.48 
 
 		 935 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.81 
 
 		 725 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 		 689 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  32.81 
 
 		 587 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>