21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2945 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  59.86 
 
 		 147 aa  189  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  41.13 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.34 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  40.15 
 
 		 150 aa  103  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  40.65 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 306 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  38.3 
 
 		 306 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  32.91 
 
 		 587 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  32.91 
 
 		 545 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.16 
 
 		 725 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.83 
 
 		 648 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  35.48 
 
 		 1324 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 523 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>