200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4277 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
468 aa  954    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  31.23 
 
 
426 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
429 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
421 aa  153  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
412 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.47 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  29.22 
 
 
279 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  28.63 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
963 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  26.91 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  26.94 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.73 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  23.4 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  28.47 
 
 
553 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 
1001 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 
1694 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  25.1 
 
 
530 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
544 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  23.64 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  25.07 
 
 
585 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
1276 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
647 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  24.71 
 
 
546 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  25.96 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  29.13 
 
 
767 aa  53.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  33 
 
 
252 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
620 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
2262 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
3560 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
4079 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.51 
 
 
1764 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.08 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.71 
 
 
810 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
3035 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 
648 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  26.39 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.18 
 
 
743 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  25.69 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1406 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
955 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
116 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1121 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  36.11 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
3145 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.73 
 
 
594 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25 
 
 
1138 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.41 
 
 
689 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
1049 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
523 aa  50.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
250 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2046  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
479 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
711 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
267 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.43 
 
 
936 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  40.26 
 
 
279 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 
875 aa  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  24.65 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
935 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 
1067 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.35 
 
 
620 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  28.1 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.34 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
716 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
503 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
243 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
212 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
744 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
827 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
1421 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
209 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4937  hypothetical protein  32.65 
 
 
822 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000992532  decreased coverage  0.0000000106484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.26 
 
 
623 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
614 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2422  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.153836  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  34.15 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
605 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
562 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
296 aa  47.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  32.58 
 
 
391 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
643 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
280 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  34.48 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 
135 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 
836 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.54 
 
 
725 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>