128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1932 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  100 
 
 		 426 aa  862    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  64.39 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  52.51 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.31 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.43 
 
 		 412 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  29.93 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  29.67 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  26.16 
 
 		 304 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  26.15 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  25.77 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  25.71 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  25.38 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  24.65 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  24.69 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  26.38 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  23.58 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.09 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 748 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 3035 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.17 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 297 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 297 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  26.67 
 
 		 471 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  29.29 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  25.15 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 3145 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  28.06 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  25.19 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  26.63 
 
 		 1180 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  26.63 
 
 		 1180 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  26.63 
 
 		 1150 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1827 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 		 1694 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  27.14 
 
 		 1160 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  26.63 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 689 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 963 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 2240 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 649 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 		 746 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  25.11 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  26.13 
 
 		 1172 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  28.36 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 879 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 605 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  27.27 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0618  hypothetical protein  28.81 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  26.11 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  28.43 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 639 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  27.94 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 827 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1096 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 1737 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.83 
 
 		 979 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 2262 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.67 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 776 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1094 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.5 
 
 		 620 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 4079 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 780 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28.28 
 
 		 582 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.36 
 
 		 1154 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>