18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2700 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  83.65 
 
 		 471 aa  805    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  934    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  43.51 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  37.98 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  24.03 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  24.79 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  25.4 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  26.99 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.67 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  26.6 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  23.33 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  24.6 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  26.94 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2106  hypothetical protein  25.21 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0433209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>