25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2470 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  37.13 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  35.79 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  34.56 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  34.31 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  35.56 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 963 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 		 1001 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  23.17 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 412 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  24.69 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  23.17 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  26.99 
 
 		 471 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  23.08 
 
 		 585 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  25.45 
 
 		 471 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  23.67 
 
 		 544 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  21.24 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  21.03 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1662  hypothetical protein  23.02 
 
 		 416 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3285  hypothetical protein  26.03 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>