29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4424 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1072    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  91.71 
 
 		 585 aa  953    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  94.69 
 
 		 530 aa  984    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  69.34 
 
 		 553 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  36.73 
 
 		 544 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 		 1001 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.38 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 963 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  25.91 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  23.17 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 468 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 639 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  19.69 
 
 		 268 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  23.23 
 
 		 408 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  26.99 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.8 
 
 		 725 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  24.28 
 
 		 286 aa  44.3  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  27.59 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 208 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>