70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1762 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  64.01 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  47.61 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  43.81 
 
 		 420 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.63 
 
 		 412 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  30.57 
 
 		 286 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  29.39 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  26.16 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  26.82 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  26.82 
 
 		 585 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  26.44 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  26.51 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  28.05 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  26.88 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 879 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  26.09 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  23.36 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  24.05 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 643 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 810 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 1737 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  26.25 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 878 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  25.78 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1257  hypothetical protein  23.47 
 
 		 365 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 594 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 963 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 576 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 2262 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1676 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  26.01 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  27.66 
 
 		 791 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1094 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  26.36 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.05 
 
 		 1078 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1381  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 759 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.918953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.9 
 
 		 594 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.81 
 
 		 1001 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 734 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  24.63 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  27.48 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 754 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.46 
 
 		 222 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.69 
 
 		 572 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 566 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 3035 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 565 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.47 
 
 		 837 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 585 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>