31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3295 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  49.26 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  42.26 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  40.08 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  40.24 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  37.23 
 
 		 268 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 1001 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  24.65 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  24.51 
 
 		 553 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  29.63 
 
 		 546 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  29.63 
 
 		 530 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  28.24 
 
 		 426 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  28.12 
 
 		 437 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  32.2 
 
 		 585 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.79 
 
 		 1078 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.99 
 
 		 970 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  22.45 
 
 		 982 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  32.67 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  26.39 
 
 		 474 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  27.75 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 963 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  20.77 
 
 		 544 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  25.41 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.79 
 
 		 976 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  23.74 
 
 		 456 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>