37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3024 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 412 aa  839    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  94.42 
 
 		 412 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  51.13 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  41.75 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  40.99 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  27.41 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  25.6 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  24.78 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  25.52 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  25.12 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  33.58 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  26.55 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 963 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  29.82 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  30.88 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  25.15 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 		 629 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  29.63 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  29.63 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  29.63 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25 
 
 		 1078 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  31.68 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  25.82 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  24.52 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  26.09 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 		 1001 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1640  hypothetical protein  24.43 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.482132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2086  hypothetical protein  26.16 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.16 
 
 		 837 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  27.07 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>