37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3174 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1089    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  36.41 
 
 		 585 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  34.65 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  37 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  36.73 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  28.92 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  24.58 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  24.33 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 963 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  24.9 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  25.29 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.33 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 		 1001 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  23.5 
 
 		 474 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 468 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  25.35 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  23.46 
 
 		 279 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  21.31 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 883 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 2240 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  20.57 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  27.03 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  26 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 405 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 		 267 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 399 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 638 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 248 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>