17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12217 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  50.81 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  50.81 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  50.4 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  52.86 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  47.56 
 
 		 283 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  39.32 
 
 		 462 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  35.26 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  31.3 
 
 		 426 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  28.4 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 421 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  32.19 
 
 		 444 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 429 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  35.14 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  28.07 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 420 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>