24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2693 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  52.59 
 
 		 426 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3123  hypothetical protein  47.02 
 
 		 424 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.27337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  39.64 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  32.85 
 
 		 444 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  33.77 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  34.02 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  30.68 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  31.22 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  28.72 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  32.67 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2858  hypothetical protein  35 
 
 		 402 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.505703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  20.73 
 
 		 304 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 963 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  47.37 
 
 		 391 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3285  hypothetical protein  25.54 
 
 		 428 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  35.14 
 
 		 507 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.16 
 
 		 1028 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 429 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  27.75 
 
 		 585 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  27.75 
 
 		 553 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>