38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0071 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  49.26 
 
 
294 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  42.34 
 
 
293 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  37.77 
 
 
286 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  36.11 
 
 
279 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  39.22 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
421 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  26.72 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  23.6 
 
 
553 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.16 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  26.32 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  25.91 
 
 
585 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 
412 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 
412 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
963 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
420 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  24.58 
 
 
544 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
1001 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  30.08 
 
 
437 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  29.46 
 
 
426 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  24.11 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  25.56 
 
 
410 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.28 
 
 
970 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  30.65 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  24.52 
 
 
1041 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  24.52 
 
 
1041 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  23.56 
 
 
1041 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  25.79 
 
 
881 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  24.62 
 
 
1012 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  27.87 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.25 
 
 
1078 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1545  hypothetical protein  26.47 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  23.76 
 
 
252 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  23.91 
 
 
444 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.3 
 
 
1028 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>