More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2423 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 881 aa  1769    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  40.57 
 
 		 901 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  27.96 
 
 		 918 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  28.72 
 
 		 956 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.45 
 
 		 970 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.09 
 
 		 976 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1021 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  31.6 
 
 		 1077 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  30.21 
 
 		 1078 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  33.39 
 
 		 1206 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  26.59 
 
 		 970 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  27.12 
 
 		 982 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.45 
 
 		 1028 aa  104  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  27 
 
 		 947 aa  102  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  22.13 
 
 		 814 aa  85.5  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  22.55 
 
 		 979 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  23.73 
 
 		 977 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.83 
 
 		 1078 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.34 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.56 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.7 
 
 		 590 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.32 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.82 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.13 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  28.02 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  34.59 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1988  hypothetical protein  22.51 
 
 		 923 aa  67.8  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.36521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 442 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.57 
 
 		 572 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.91 
 
 		 1010 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  22.14 
 
 		 1060 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.88 
 
 		 292 aa  67  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  33.62 
 
 		 451 aa  67  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  33.96 
 
 		 1082 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  26.37 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.29 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.49 
 
 		 1005 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  27.47 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.67 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32.59 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  28.78 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.81 
 
 		 428 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  26.09 
 
 		 437 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.9 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 432 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  41.25 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  41.25 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.57 
 
 		 1059 aa  62.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 442 aa  62  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.23 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.41 
 
 		 450 aa  62  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.98 
 
 		 431 aa  62  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.58 
 
 		 442 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 		 969 aa  61.6  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.05 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.76 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.14 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 434 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.92 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 436 aa  60.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.98 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.98 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.46 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.86 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.56 
 
 		 1090 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.04 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  33.1 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  44.07 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  36.36 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  45.61 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  28.8 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>