16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2418 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  30.08 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  24.09 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 468 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3356  hypothetical protein  30.25 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  22.7 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  30.23 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  25.1 
 
 		 670 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  22.63 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1620  hypothetical protein  24.49 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  23.41 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.9 
 
 		 642 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  24.2 
 
 		 647 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>